A kutatók új adatokat szolgáltatnak a genom háromdimenziós szerkezetéről

2013. június 24., hétfő. - Az ausztráliai és az amerikai tudósok új ismereteket adnak a genom háromdimenziós szerkezetének megértéséhez, amely a genomika és genetika területén jelenleg az egyik legnagyobb kihívás, amelynek következtetéseit közzéteszi a digitális kiadásában. Természetgenetika ”.

Körülbelül három méteres DNS-t szorosan összehajtjuk a testünk minden egyes sejtjében, ami lehetővé teszi, hogy egyes gének "expresszálódjanak" vagy aktiválódjanak, mások kivételével. Tim Mercer és John Mattick a Sydney-i Garvan Orvosi Kutatási Intézetből és John Stamatoyannopoulos professzor a seattle-i Washington Egyetemen nagy felbontásúan elemezték a genom 3D-s szerkezetét.
A gének "exonokból" és "intronokból" állnak, amelyek közül az első a fehérjéket kódoló és expresszáló szekvenciák, az utolsó pedig a közegben nem kódoló DNS szakaszai. Amint a géneket lemásolják vagy átírják, az RNS-ből származó DNS-ből az intronszekvenciákat levágják vagy "összeillesztik", és a fennmaradó exonokat összekapcsolják, hogy egy fehérjét kódoló szekvenciát képezzenek. Az elágazott exonoktól függően ugyanaz a gén különféle fehérjéket generálhat.
Az ENCODE projekt nagy mennyiségű adatainak felhasználásával Dr. Tim Mercer és kollégái levonják a genom hajtogatását, megállapítva, hogy a kiválasztott exonok még egy génön belül is könnyen ki vannak téve. "Képzeljünk el egy hosszú és rendkívül bonyolult szőlőt, annak sodrott ágain, amelyek olyan szőlőket tartalmaznak, amelyek könnyen letéphetők, miközben mások elrejtik őket elérhetetlenségük alatt" - példázza. Mercer.
"Ugyanakkor képzeljünk el egy lusta gyümölcsszedőt, amely csak a keze ügyében veszi a szőlőt, " tette hozzá. "Ugyanez az elv vonatkozik a genomra is. Specifikus gének, sőt konkrét exonok is elérhetők a hajtogatás során." Ebben a tekintetben ez a kutató rámutat arra, hogy az utóbbi években a tudósok elkezdték felértékelni, hogy a genom hajtogatása hogyan segít meghatározni annak expresszálódását és szabályozását.
"Ez a tanulmány az első jelzést ad arra, hogy a genom háromdimenziós szerkezete befolyásolhatja a gének összeillesztését. Megállapíthatjuk, hogy a genom oly módon hajlik össze, hogy a promoter régió, a szekvencia, amely egy gén transzkripcióját iniciálja, az exonok mellett találhatók, és mindegyikét átviszik az átírógépbe "- hangsúlyozza.
"Ez támogatja a dolgok új nézőpontját, amely szerint a genom a transzkripciós gépek körül hajlik, nem pedig fordítva. Azok a gének, amelyek érintkezésbe kerülnek a transzkripciós gépekkel, másolatot kapnak, míg azok a részek, amelyek messze keringnek ezeket figyelmen kívül hagyják "- fejezi be a kutató.
Forrás: www.DiarioSalud.net